Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 AL606490.8-201ENST00000441624 319 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.2 ms