Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 MTCO1P8-201ENST00000416914 1523 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 HMGB1P32-201ENST00000425971 565 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 FCF1P7-201ENST00000451185 558 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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