Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ARHGEF3Q9NR81 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.8 ms