Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

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Length 828 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 AL034374.2-201ENST00000605281 548 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 OR4G1P-202ENST00000641173 1788 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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COG3Q96JB2 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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COG3Q96JB2 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
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COG3Q96JB2 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 ASPH-226ENST00000522919 1277 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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COG3Q96JB2 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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COG3Q96JB2 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
COG3Q96JB2 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
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