Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NDUFA9Q16795 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NDUFA9Q16795 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NDUFA9Q16795 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NDUFA9Q16795 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NDUFA9Q16795 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NDUFA9Q16795 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NDUFA9Q16795 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NDUFA9Q16795 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NDUFA9Q16795 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NDUFA9Q16795 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NDUFA9Q16795 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NDUFA9Q16795 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NDUFA9Q16795 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NDUFA9Q16795 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NDUFA9Q16795 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NDUFA9Q16795 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NDUFA9Q16795 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NDUFA9Q16795 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NDUFA9Q16795 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NDUFA9Q16795 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NDUFA9Q16795 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NDUFA9Q16795 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NDUFA9Q16795 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NDUFA9Q16795 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NDUFA9Q16795 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NDUFA9Q16795 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NDUFA9Q16795 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NDUFA9Q16795 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NDUFA9Q16795 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NDUFA9Q16795 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NDUFA9Q16795 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NDUFA9Q16795 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NDUFA9Q16795 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NDUFA9Q16795 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NDUFA9Q16795 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NDUFA9Q16795 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NDUFA9Q16795 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NDUFA9Q16795 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NDUFA9Q16795 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NDUFA9Q16795 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NDUFA9Q16795 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NDUFA9Q16795 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NDUFA9Q16795 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NDUFA9Q16795 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NDUFA9Q16795 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NDUFA9Q16795 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NDUFA9Q16795 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NDUFA9Q16795 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NDUFA9Q16795 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
NDUFA9Q16795 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
NDUFA9Q16795 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
NDUFA9Q16795 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
NDUFA9Q16795 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
NDUFA9Q16795 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NDUFA9Q16795 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NDUFA9Q16795 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NDUFA9Q16795 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NDUFA9Q16795 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NDUFA9Q16795 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NDUFA9Q16795 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NDUFA9Q16795 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NDUFA9Q16795 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NDUFA9Q16795 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NDUFA9Q16795 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NDUFA9Q16795 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NDUFA9Q16795 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NDUFA9Q16795 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NDUFA9Q16795 AL133372.2-203ENST00000508469 922 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NDUFA9Q16795 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NDUFA9Q16795 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NDUFA9Q16795 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NDUFA9Q16795 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NDUFA9Q16795 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NDUFA9Q16795 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NDUFA9Q16795 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NDUFA9Q16795 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NDUFA9Q16795 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NDUFA9Q16795 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NDUFA9Q16795 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NDUFA9Q16795 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NDUFA9Q16795 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NDUFA9Q16795 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NDUFA9Q16795 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NDUFA9Q16795 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NDUFA9Q16795 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NDUFA9Q16795 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NDUFA9Q16795 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NDUFA9Q16795 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NDUFA9Q16795 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NDUFA9Q16795 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NDUFA9Q16795 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NDUFA9Q16795 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NDUFA9Q16795 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NDUFA9Q16795 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NDUFA9Q16795 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NDUFA9Q16795 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NDUFA9Q16795 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NDUFA9Q16795 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NDUFA9Q16795 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms