Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PDGFRLQ15198 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 LINC01587-204ENST00000623565 873 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDGFRLQ15198 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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