Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 EMX2OS-201ENST00000412075 1025 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC095033.1-201ENST00000451611 1096 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC135983.3-201ENST00000528049 1226 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC022509.1-202ENST00000537525 494 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AL589765.6-201ENST00000601909 549 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms