Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 FTO-203ENST00000460382 1517 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
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