Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AGGF1P3-201ENST00000493675 1213 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AC124856.1-201ENST00000600819 896 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
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CUL1Q13616 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
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CUL1Q13616 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 GK-IT1-201ENST00000441146 397 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
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