Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AP002954.1-201ENST00000526274 425 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 OR7E19P-202ENST00000589942 844 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AL137000.1-201ENST00000610528 1244 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 SGO1-AS1-206ENST00000635369 442 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 MBD5-221ENST00000637159 902 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 LEKR1-201ENST00000356539 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC245036.1-201ENST00000391727 309 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 RNA5SP231-201ENST00000410496 138 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC016745.1-201ENST00000422178 508 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AL845321.1-201ENST00000444603 348 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 TREML3P-201ENST00000457327 501 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 RPS3AP49-201ENST00000472161 790 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 RN7SKP196-201ENST00000516267 345 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AP003467.1-201ENST00000517397 301 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 TPRXL-210ENST00000532753 478 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC015911.2-201ENST00000585536 396 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 ZNF431-203ENST00000594425 610 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TOP3AQ13472 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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