Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 KCNJ10-207ENST00000638868 3883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 SH2D1B-201ENST00000367929 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 IKZF3-215ENST00000535189 1996 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 BTK-209ENST00000618050 2417 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 PSG6-204ENST00000402603 1412 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 TRIM49D1-203ENST00000605881 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC118754.1-201ENST00000416958 370 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 Z82198.3-201ENST00000421145 199 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 RPS7P12-201ENST00000422385 582 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AL358394.1-201ENST00000422807 535 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 OR13C7-201ENST00000424348 959 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AL606534.4-201ENST00000427176 792 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 GAPDHP19-201ENST00000431768 1005 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 LAMTOR5-AS1-201ENST00000444238 881 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 UBBP5-201ENST00000446970 266 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AL354989.1-201ENST00000448245 635 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 RPL26P30-201ENST00000453533 435 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AKR1D1P1-201ENST00000457236 936 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC091868.2-201ENST00000506717 556 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
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FOXE3Q13461 AC135983.3-201ENST00000528049 1226 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 TRIM69-208ENST00000560442 1262 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AL390718.1-201ENST00000566904 506 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC087392.1-201ENST00000576252 820 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 ARGFXP2-201ENST00000579304 949 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AL390877.1-201ENST00000605704 214 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 Z98949.1-217ENST00000609275 994 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 EDRF1-AS1-210ENST00000613304 569 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 MIR6503-201ENST00000622884 86 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 WDR93-204ENST00000558000 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
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