Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 LINC01773-201ENST00000437598 787 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
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