Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 C1orf194-202ENST00000369945 534 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 CYP3A5-203ENST00000439761 1075 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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