Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 SOCS5P1-201ENST00000440415 949 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
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