Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 CPB2-AS1-201ENST00000415033 747 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SREBF2Q12772 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SREBF2Q12772 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
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