Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CENPFP49454 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CENPFP49454 AP005901.4-201ENST00000577336 569 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CENPFP49454 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CENPFP49454 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CENPFP49454 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CENPFP49454 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CENPFP49454 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CENPFP49454 NOS1-206ENST00000618760 12283 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CENPFP49454 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CENPFP49454 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CENPFP49454 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CENPFP49454 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CENPFP49454 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CENPFP49454 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CENPFP49454 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CENPFP49454 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CENPFP49454 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CENPFP49454 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CENPFP49454 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CENPFP49454 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CENPFP49454 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CENPFP49454 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CENPFP49454 ZNF639-201ENST00000326361 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CENPFP49454 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CENPFP49454 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CENPFP49454 MCTP2-201ENST00000357742 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CENPFP49454 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CENPFP49454 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CENPFP49454 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CENPFP49454 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CENPFP49454 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CENPFP49454 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CENPFP49454 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CENPFP49454 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CENPFP49454 LPP-208ENST00000448637 5835 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CENPFP49454 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CENPFP49454 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CENPFP49454 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CENPFP49454 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CENPFP49454 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CENPFP49454 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CENPFP49454 ITGA2-201ENST00000296585 7869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CENPFP49454 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CENPFP49454 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CENPFP49454 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CENPFP49454 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CENPFP49454 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CENPFP49454 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CENPFP49454 PPHLN1-225ENST00000619544 1449 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CENPFP49454 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CENPFP49454 GMDS-AS1-202ENST00000505870 8217 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CENPFP49454 ZNF292-202ENST00000369577 10610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CENPFP49454 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CENPFP49454 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CENPFP49454 CSNK1G1-201ENST00000303052 8179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CENPFP49454 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CENPFP49454 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CENPFP49454 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CENPFP49454 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CENPFP49454 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CENPFP49454 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CENPFP49454 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CENPFP49454 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CENPFP49454 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CENPFP49454 AL079307.1-201ENST00000553312 5982 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CENPFP49454 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CENPFP49454 CTNND1-227ENST00000530748 5925 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CENPFP49454 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CENPFP49454 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CENPFP49454 MIGA1-202ENST00000443751 6409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CENPFP49454 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CENPFP49454 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CENPFP49454 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CENPFP49454 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CENPFP49454 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CENPFP49454 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CENPFP49454 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CENPFP49454 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CENPFP49454 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CENPFP49454 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CENPFP49454 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CENPFP49454 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CENPFP49454 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CENPFP49454 WNK3-203ENST00000375169 11172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CENPFP49454 MAPK8-205ENST00000374182 5638 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CENPFP49454 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CENPFP49454 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CENPFP49454 ZFX-204ENST00000379188 7513 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CENPFP49454 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CENPFP49454 AC008171.1-201ENST00000395058 200 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CENPFP49454 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CENPFP49454 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CENPFP49454 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CENPFP49454 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CENPFP49454 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CENPFP49454 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CENPFP49454 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CENPFP49454 TP53BP1-203ENST00000382044 10384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CENPFP49454 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms