Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 HTR2C-202ENST00000371950 4652 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 RAPGEF5-212ENST00000620335 5506 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 TTC7B-201ENST00000328459 19458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 C1GALT1-201ENST00000223122 6078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 AC106886.5-201ENST00000380361 11692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 XIAP-202ENST00000371199 8591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 PTPRT-205ENST00000373193 12681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
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PKHD1P08F94 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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PKHD1P08F94 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
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PKHD1P08F94 DSP-202ENST00000418664 7812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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PKHD1P08F94 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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PKHD1P08F94 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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PKHD1P08F94 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
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