Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 LRAT-206ENST00000507827 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 TUBBP10-201ENST00000427668 1301 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 B4GALT4-207ENST00000467604 5794 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 RGS6-205ENST00000406236 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC097478.1-207ENST00000612706 2422 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01697-202ENST00000426534 1764 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 PZP-201ENST00000261336 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 TTR-201ENST00000237014 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 S100A5-202ENST00000368718 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 CBWD5-205ENST00000377395 1143 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 ALOX5AP-201ENST00000380490 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 TRAV8-3-201ENST00000390435 341 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC093107.1-201ENST00000422772 609 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AL354983.1-201ENST00000434580 906 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 TDRG1-202ENST00000448433 1015 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 TCEAL4P1-201ENST00000453620 588 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AL357143.1-201ENST00000457239 934 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 NDUFS5P2-201ENST00000484004 306 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF695-204ENST00000487338 826 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 GAPDHP61-201ENST00000507324 1005 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC092336.1-201ENST00000510562 415 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01606-205ENST00000519314 562 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC126755.2-209ENST00000531453 699 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC138969.1-212ENST00000541593 699 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 NPIPA5-203ENST00000543801 699 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AL136018.1-202ENST00000555300 488 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 DRAIC-206ENST00000559029 309 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 IQCK-206ENST00000564186 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC013640.1-201ENST00000565366 565 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4786-201ENST00000583954 80 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 5S_rRNA.20-201ENST00000612104 118 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC233702.2-201ENST00000618784 583 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 CEBPZ-201ENST00000234170 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 INTS2-207ENST00000617492 5805 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC067968.1-201ENST00000591793 3766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 ERMARD-202ENST00000366772 2003 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 MPP7-201ENST00000337532 5080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC016831.1-201ENST00000432045 6411 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 CEACAM6-201ENST00000199764 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 ADI1-202ENST00000382093 3870 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC099062.1-202ENST00000640362 3864 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 ENSA-201ENST00000271690 2818 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC100810.3-201ENST00000633189 2240 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 CYBRD1-203ENST00000409484 1493 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 CTNNA1-244ENST00000627109 3831 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 CACHD1-201ENST00000290039 5275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 CDH17-203ENST00000450165 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGAP20-205ENST00000529591 2623 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 ARNTL2-203ENST00000311001 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 NSRP1-217ENST00000612959 2420 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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