Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 LDHBP3-201ENST00000514909 822 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
COG3Q96JB2 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.8 ms