Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AC012593.1-208ENST00000587791 696 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 ZNF137P-202ENST00000597158 308 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 TRIM69-202ENST00000338264 1222 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 SEC61G-201ENST00000352861 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AC104463.1-201ENST00000411431 365 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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ANKRD42Q8N9B4 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
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ANKRD42Q8N9B4 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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ANKRD42Q8N9B4 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AC022021.1-201ENST00000634334 843 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD42Q8N9B4 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD42Q8N9B4 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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