Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CLDN19Q8N6F1 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CLDN19Q8N6F1 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CLDN19Q8N6F1 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CLDN19Q8N6F1 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CLDN19Q8N6F1 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CLDN19Q8N6F1 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CLDN19Q8N6F1 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.61
CLDN19Q8N6F1 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
CLDN19Q8N6F1 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
CLDN19Q8N6F1 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
CLDN19Q8N6F1 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
CLDN19Q8N6F1 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
CLDN19Q8N6F1 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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CLDN19Q8N6F1 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 SEPT14P1-201ENST00000458703 648 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CLDN19Q8N6F1 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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