Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 KIAA1958-203ENST00000536272 7650 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 PCDH19-201ENST00000255531 7937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 PCDH19-203ENST00000420881 7936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 FZD10-AS1-201ENST00000505807 10193 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 LINC01793-201ENST00000409590 2036 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 CBFA2T2-204ENST00000359606 7274 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 LHX9-201ENST00000367387 7836 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 DST-207ENST00000421834 18030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 KIAA0100-201ENST00000389003 6852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 A2ML1-201ENST00000299698 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 DDX52-213ENST00000617633 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 KIAA1210-201ENST00000402510 7824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 ZSCAN12-201ENST00000361028 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 STAB2-201ENST00000388887 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 BCOR-205ENST00000397354 6258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 ETV1-201ENST00000242066 6348 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 KCNA2-214ENST00000640774 6673 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 PLXNA2-201ENST00000367033 11444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
USP34Q70CQ2 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms