Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 BABAM2-201ENST00000342045 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 BABAM2-203ENST00000361704 1686 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 ZNF812P-201ENST00000457674 1694 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 UBE2V1-201ENST00000340309 2536 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 TRIM6-TRIM34-201ENST00000354852 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 ZNF438-201ENST00000331737 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 GCNA-201ENST00000373695 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 LINC01087-201ENST00000431979 3516 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 EIF2A-202ENST00000406576 1795 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 SGCD-202ENST00000435422 9755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 AL139384.2-201ENST00000613809 3590 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 DNAH17-202ENST00000585328 13708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 AC008080.4-201ENST00000420185 1589 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 OR13C1P-201ENST00000457612 963 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 C1orf105-204ENST00000460397 462 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 AC006441.1-201ENST00000581083 437 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 AC011468.3-201ENST00000597886 332 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 MYOF-202ENST00000359263 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 SPATA31B1P-201ENST00000434692 4016 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 GOLGB1-201ENST00000340645 11187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 BTK-209ENST00000618050 2417 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 SERPINB8-208ENST00000542677 3192 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 HABP2-201ENST00000351270 3009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 NBPF26-204ENST00000615145 2656 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 NREP-206ENST00000447165 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 CHST12-201ENST00000258711 15979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 NDUFA4-201ENST00000339600 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 CLYBL-AS2-201ENST00000430125 695 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 LINC01918-202ENST00000438148 415 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.6 ms