Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 FRMPD3-201ENST00000276185 7304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 HIVEP3-202ENST00000372584 12319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AC024451.1-201ENST00000508013 779 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 KIAA0391-201ENST00000250377 6118 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 NRCAM-203ENST00000379024 5782 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 LRRC37A9P-201ENST00000603850 5376 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 EFCAB6-203ENST00000396231 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 LINC01128-205ENST00000445118 6606 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 MAPRE2-203ENST00000436190 4323 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 ARNT2-207ENST00000533983 6690 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 KIDINS220-206ENST00000473731 7248 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 UNC5D-201ENST00000287272 8662 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 TOR1AIP2-203ENST00000482587 7067 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 RBM23-203ENST00000359890 10040 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 HECTD4-202ENST00000377560 15759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 ZRANB1-201ENST00000359653 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 NHLRC2-201ENST00000369301 11051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 STARD4-AS1-201ENST00000500779 5525 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 RGMA-201ENST00000329082 11350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 ILDR2-201ENST00000271417 13140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AC008655.2-201ENST00000597049 304 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 CACNA1E-205ENST00000367570 9724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms