Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AL133372.1-201ENST00000493565 745 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109 ms