Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 MAP1LC3C-201ENST00000357246 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 CENPW-201ENST00000368325 528 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AL441963.1-201ENST00000435137 792 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 WBP1LP1-201ENST00000460451 896 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 RN7SL505P-201ENST00000482644 293 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AC098864.1-202ENST00000507869 2129 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 GNGT2-205ENST00000511673 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 GAPDHP44-201ENST00000513513 1007 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC9.57□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 OTX2-204ENST00000554788 835 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 MPPE1P1-201ENST00000557286 1076 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 EDRF1-AS1-205ENST00000601363 712 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 RBM22P6-201ENST00000611682 867 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AC002094.4-201ENST00000613598 307 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AL355480.4-201ENST00000626823 69 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 ANAPC1-210ENST00000628342 450 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AL049839.2-201ENST00000553947 3067 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 SYNJ1-211ENST00000630077 6898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AC044810.2-202ENST00000527847 2503 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 ZNF585B-203ENST00000527838 2732 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AL022323.2-201ENST00000623239 3000 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 NAT10-210ENST00000615292 3329 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 STAG2-201ENST00000218089 5218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 SPATA13-201ENST00000343003 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 KIF9-AS1-201ENST00000429315 4898 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 ARNTL2-207ENST00000542388 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 ALMS1-204ENST00000484298 12595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 ADGRF2-201ENST00000296862 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 LRFN5-203ENST00000554120 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 FGA-202ENST00000403106 2248 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 SLFN12-206ENST00000452764 2423 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 SMIM12-204ENST00000446026 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 SUB1-201ENST00000265073 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 BTN3A2-205ENST00000508906 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 NAV2-213ENST00000533917 5084 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 KPNB1-202ENST00000535458 3163 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 MCTP1-205ENST00000505208 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 HEPACAM2-203ENST00000440868 2060 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AC092718.7-201ENST00000623577 1776 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 RNA5SP336-201ENST00000364189 117 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 S100A13-202ENST00000392622 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 RN7SL745P-201ENST00000484900 299 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 GAPDHP22-201ENST00000491037 413 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AP002026.1-204ENST00000506454 749 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AC008581.1-201ENST00000512650 385 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AC097103.2-205ENST00000515247 567 ntTSL 4 BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
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MKRN4PQ13434 AL110292.1-202ENST00000552303 568 ntTSL 4 BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AC027688.2-201ENST00000569009 511 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AC090774.2-201ENST00000584708 322 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 VDAC1P5-201ENST00000603132 844 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AL008726.1-201ENST00000607703 569 ntTSL 4 BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 IMPG1-204ENST00000611179 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 MYRFL-205ENST00000552032 3139 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 ZNF573-201ENST00000339503 2014 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 RBMXL1-202ENST00000399794 5084 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 SUPT20H-224ENST00000542180 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 SLC24A1-203ENST00000399033 3323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 AL513523.1-201ENST00000417868 1309 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 CNDP1-203ENST00000582365 4111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 NEK1-207ENST00000511633 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 NRP1-207ENST00000374875 5407 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN4PQ13434 MYH2-204ENST00000532183 2528 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
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