Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 MEF2C-244ENST00000636998 5936 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 GREM1-203ENST00000622074 14606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 KIAA1210-201ENST00000402510 7824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 PPHLN1-225ENST00000619544 1449 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
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TCOF1Q13428 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 ERC1-204ENST00000397203 9118 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 AHSA2-203ENST00000410073 479 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
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