Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 FTO-203ENST00000460382 1517 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms