Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 NAV2-216ENST00000540292 11003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 CDK19-201ENST00000323817 6067 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 ABCF2P1-201ENST00000465687 1867 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 SSPO-201ENST00000378016 15589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 HOOK3-201ENST00000307602 14398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 MARCH6-204ENST00000503788 2874 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 DLG2-229ENST00000531015 2892 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AL136140.2-201ENST00000624717 1705 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 SCAND2P-201ENST00000348993 8975 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 SPP2-201ENST00000168148 1024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 RNA5SP396-201ENST00000364834 120 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 SNORA30-201ENST00000384028 129 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 SOD1P1-201ENST00000407803 440 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AC099535.1-201ENST00000408928 371 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AL589794.1-201ENST00000424971 390 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AL356133.1-201ENST00000444762 372 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 YAP1P2-201ENST00000455104 610 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 TFP1-201ENST00000460564 572 ntTSL 4 BASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 TFP1-203ENST00000490470 561 ntTSL 4 BASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AC100823.2-201ENST00000518337 699 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 RPARP-AS1-204ENST00000594818 445 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AC005070.2-201ENST00000604391 260 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AC005303.1-201ENST00000607906 740 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AC011632.1-202ENST00000518128 2810 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
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MKRN3Q13064 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 CALML4-203ENST00000395465 4155 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 SELENOP-203ENST00000506577 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 ADCY10P1-203ENST00000567255 4569 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AKT3-203ENST00000366539 5127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 FANCM-201ENST00000267430 7111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 DTHD1-206ENST00000639862 3819 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AC093768.1-201ENST00000505987 2173 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 ZNF407-207ENST00000582337 5662 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 RAB3IP-215ENST00000551641 2840 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
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MKRN3Q13064 NPFFR2-204ENST00000395999 1866 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
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MKRN3Q13064 SUPT7L-201ENST00000337768 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
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MKRN3Q13064 MYB-238ENST00000534044 1812 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
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MKRN3Q13064 ZNF136-201ENST00000343979 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
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MKRN3Q13064 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
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MKRN3Q13064 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 PPIAP30-201ENST00000415473 519 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AF274573.1-201ENST00000430535 494 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 LINC01805-201ENST00000436433 572 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AL604028.2-201ENST00000437848 788 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 TRBV5-4-201ENST00000454561 544 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 OR9A1P-202ENST00000484361 945 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 MRPL57P6-201ENST00000506570 309 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 FBXO16-208ENST00000519471 398 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AC156455.1-201ENST00000538790 851 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
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