Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 CR383656.14-201ENST00000551951 406 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 EIF4A2P2-201ENST00000455776 1070 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC106806.2-201ENST00000509365 500 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
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