Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AL451046.1-201ENST00000406097 534 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
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