Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AL034374.2-201ENST00000605281 548 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 RAPGEF5-202ENST00000401957 6159 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 METTL14-201ENST00000388822 6669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 ZFP37-201ENST00000374227 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AC123769.2-201ENST00000624332 5984 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 LAMA2-205ENST00000617695 9678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 LAMA2-206ENST00000618192 9687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 POLQ-204ENST00000621776 9055 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 SGCD-202ENST00000435422 9755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 KCNIP4-202ENST00000382148 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 DENND2C-201ENST00000393274 6163 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AC040173.1-201ENST00000572479 580 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 ERLIN2-201ENST00000276461 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 BCOR-203ENST00000378455 6338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 KPNA6-201ENST00000373625 7378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 UG0898H09-202ENST00000623646 7040 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 GRIA4-212ENST00000530497 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 DCP2-201ENST00000389063 8947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
BPTFQ12830 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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