Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
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CENPFP49454 RBM23-203ENST00000359890 10040 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CENPFP49454 AP000542.3-201ENST00000623391 6114 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CENPFP49454 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CENPFP49454 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CENPFP49454 ATOX1-203ENST00000521264 4341 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CENPFP49454 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CENPFP49454 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CENPFP49454 AL139350.1-201ENST00000448825 408 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CENPFP49454 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CENPFP49454 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CENPFP49454 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CENPFP49454 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CENPFP49454 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CENPFP49454 METTL2B-204ENST00000480046 5743 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CENPFP49454 ERBB4-205ENST00000436443 12084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CENPFP49454 IL16-204ENST00000394660 9616 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CENPFP49454 MDM4-204ENST00000367183 9098 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CENPFP49454 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CENPFP49454 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CENPFP49454 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CENPFP49454 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CENPFP49454 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CENPFP49454 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CENPFP49454 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CENPFP49454 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CENPFP49454 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CENPFP49454 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CENPFP49454 MIPOL1-201ENST00000327441 7185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CENPFP49454 LIN7A-204ENST00000552864 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CENPFP49454 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CENPFP49454 PLA2R1-201ENST00000283243 14371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CENPFP49454 FBXO40-201ENST00000338040 5929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CENPFP49454 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
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CENPFP49454 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CENPFP49454 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CENPFP49454 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CENPFP49454 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CENPFP49454 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
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CENPFP49454 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
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CENPFP49454 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CENPFP49454 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
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CENPFP49454 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CENPFP49454 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CENPFP49454 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
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CENPFP49454 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
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CENPFP49454 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
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CENPFP49454 AP3M1-201ENST00000355264 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CENPFP49454 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CENPFP49454 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CENPFP49454 PPP1R12B-216ENST00000608999 15248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CENPFP49454 NBPF19-206ENST00000621744 14425 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CENPFP49454 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CENPFP49454 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CENPFP49454 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CENPFP49454 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CENPFP49454 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
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