Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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LRRTM2O43300 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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LRRTM2O43300 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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LRRTM2O43300 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
LRRTM2O43300 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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