Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 CYTOR-204ENST00000409898 560 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 MIR4435-2HG-214ENST00000453478 560 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 AC023632.6-201ENST00000624338 2177 ntBASIC5□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC5□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC5□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC5□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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APOC4-APOC2K7ER74 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
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APOC4-APOC2K7ER74 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC5□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
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APOC4-APOC2K7ER74 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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APOC4-APOC2K7ER74 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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APOC4-APOC2K7ER74 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC5□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 AP001610.2-201ENST00000415820 422 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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APOC4-APOC2K7ER74 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
APOC4-APOC2K7ER74 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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