Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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