Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTNNAL1Q9UBT7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CTNNAL1Q9UBT7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CTNNAL1Q9UBT7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CTNNAL1Q9UBT7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
CTNNAL1Q9UBT7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CTNNAL1Q9UBT7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CTNNAL1Q9UBT7 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CTNNAL1Q9UBT7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CTNNAL1Q9UBT7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTNNAL1Q9UBT7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTNNAL1Q9UBT7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTNNAL1Q9UBT7 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTNNAL1Q9UBT7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTNNAL1Q9UBT7 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CTNNAL1Q9UBT7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTNNAL1Q9UBT7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTNNAL1Q9UBT7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTNNAL1Q9UBT7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CTNNAL1Q9UBT7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTNNAL1Q9UBT7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CTNNAL1Q9UBT7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTNNAL1Q9UBT7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTNNAL1Q9UBT7 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTNNAL1Q9UBT7 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTNNAL1Q9UBT7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTNNAL1Q9UBT7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTNNAL1Q9UBT7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTNNAL1Q9UBT7 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTNNAL1Q9UBT7 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTNNAL1Q9UBT7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms