Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNRC6CQ9HCJ0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNRC6CQ9HCJ0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNRC6CQ9HCJ0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNRC6CQ9HCJ0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNRC6CQ9HCJ0 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNRC6CQ9HCJ0 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNRC6CQ9HCJ0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNRC6CQ9HCJ0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNRC6CQ9HCJ0 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNRC6CQ9HCJ0 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNRC6CQ9HCJ0 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNRC6CQ9HCJ0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNRC6CQ9HCJ0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TNRC6CQ9HCJ0 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNRC6CQ9HCJ0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNRC6CQ9HCJ0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TNRC6CQ9HCJ0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNRC6CQ9HCJ0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNRC6CQ9HCJ0 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNRC6CQ9HCJ0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNRC6CQ9HCJ0 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNRC6CQ9HCJ0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNRC6CQ9HCJ0 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNRC6CQ9HCJ0 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TNRC6CQ9HCJ0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNRC6CQ9HCJ0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNRC6CQ9HCJ0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNRC6CQ9HCJ0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNRC6CQ9HCJ0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNRC6CQ9HCJ0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNRC6CQ9HCJ0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNRC6CQ9HCJ0 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNRC6CQ9HCJ0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNRC6CQ9HCJ0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNRC6CQ9HCJ0 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TNRC6CQ9HCJ0 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TNRC6CQ9HCJ0 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNRC6CQ9HCJ0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNRC6CQ9HCJ0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TNRC6CQ9HCJ0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNRC6CQ9HCJ0 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TNRC6CQ9HCJ0 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNRC6CQ9HCJ0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNRC6CQ9HCJ0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNRC6CQ9HCJ0 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNRC6CQ9HCJ0 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNRC6CQ9HCJ0 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNRC6CQ9HCJ0 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TNRC6CQ9HCJ0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TNRC6CQ9HCJ0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TNRC6CQ9HCJ0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms