Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCAS3Q9H6U6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCAS3Q9H6U6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms