Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLSTN2Q9H4D0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms