Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQI5

Ppbp, Chemokine (C-X-C motif) ligand 7, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpbpQ9EQI5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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PpbpQ9EQI5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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PpbpQ9EQI5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms