Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC47Q96A33 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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