Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms