Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF182Q8N6D2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms