Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPTE2Q6XPS3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms