Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LRSAM1Q6UWE0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRSAM1Q6UWE0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms