Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCLAFQ15004 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCLAFQ15004 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms