Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SF3B2Q13435 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
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