Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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SKP2Q13309 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKP2Q13309 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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