Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXC1Q12948 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms